东起同盛胡同，西至兴隆胡同，长360米，宽4～12米。南侧与校书里、李家胡同、海顺胡同相交。1936年，侵华日军在北边占北孔庄子等地建东仓库时，南孔庄子成为居民住宅区，其巷因庄子而得名。